NCBI常用的序列搜索比對(duì)工具是BLAST。

BLAST是NCBI中常用的序列搜索比對(duì)工具，用于在DNA、蛋白質(zhì)等生物信息學(xué)領(lǐng)域進(jìn)行序列比對(duì)和相似性搜索。BLAST通過(guò)算法對(duì)輸入的序列進(jìn)行比對(duì)，在數(shù)據(jù)庫(kù)中找到相似的序列。該工具廣泛應(yīng)用于基因功能研究、物種鑒定、蛋白質(zhì)相互作用等領(lǐng)域。以下是關(guān)于BLAST的詳細(xì)介紹：

BLAST作為NCBI的核心工具之一，對(duì)于生物信息學(xué)研究者來(lái)說(shuō)至關(guān)重要。它能夠快速準(zhǔn)確地搜索和比對(duì)生物序列，幫助研究者找到相似的基因或蛋白質(zhì)序列。該工具不僅適用于科研人員，也適用于廣大生物學(xué)愛(ài)好者以及需要基礎(chǔ)生物信息學(xué)知識(shí)的其他領(lǐng)域的研究人員。BLAST的應(yīng)用范圍非常廣泛，從基因組學(xué)到蛋白質(zhì)組學(xué)，從基礎(chǔ)研究到臨床應(yīng)用，都發(fā)揮著不可替代的作用。

其強(qiáng)大的搜索功能使研究者能夠快速獲取有關(guān)基因或蛋白質(zhì)的信息，為后續(xù)的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)和數(shù)據(jù)分析提供了重要支持。NCBI還提供了多種不同類(lèi)型的BLAST工具，如用于核酸序列比對(duì)的BLASTn、用于蛋白質(zhì)序列比對(duì)的BLASTp等，以滿(mǎn)足不同研究需求。這些工具的使用非常簡(jiǎn)單，用戶(hù)只需在NCBI網(wǎng)站上的BLAST界面輸入待查詢(xún)的序列，選擇相應(yīng)的數(shù)據(jù)庫(kù)和比對(duì)參數(shù)，即可快速獲得比對(duì)結(jié)果。這些結(jié)果可以幫助研究者了解序列的相似性和進(jìn)化關(guān)系等重要信息。

總的來(lái)說(shuō)，NCBI的BLAST工具是生物信息學(xué)領(lǐng)域非常重要的序列搜索比對(duì)工具，對(duì)于生物學(xué)研究和相關(guān)領(lǐng)域的探索具有重要意義。

【答案】：主要分析工具有：①Find genes工具：幫助快速尋找指定基因的功能；②Cluster heatmap工具：聚類(lèi)圖分析工具；③Query Group A versus B工具：兩個(gè)子集比較下的查詢(xún)工具。④Experiment design and Value distribution：實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和數(shù)據(jù)分布查看工具，用戶(hù)可大概了解一個(gè)數(shù)據(jù)集的數(shù)值分布狀態(tài)。⑤GEOBLAST，GEO數(shù)據(jù)比對(duì)工具，供用戶(hù)使用BLAET搜索感興趣的核苷酸序列的相似序列的GEO基因表達(dá)譜。⑥Subset effects：子集效應(yīng)。如果不同子集間的基因表達(dá)值或秩次存在顯著性差異，那么這些表達(dá)譜會(huì)被自動(dòng)標(biāo)記，用戶(hù)可以通過(guò)這個(gè)特性檢索所有相關(guān)的表達(dá)譜。

任何web軟件和應(yīng)用程序都需要強(qiáng)大的數(shù)據(jù)庫(kù)管理工具，因此開(kāi)發(fā)者選擇一款合適的數(shù)據(jù)庫(kù)管理工具尤為重要。北京電腦培訓(xùn)列出了幾款好用的數(shù)據(jù)庫(kù)管理工具（有些并非開(kāi)源或免費(fèi)），以供開(kāi)發(fā)者們參考選擇：

1、MySQL管理工具phpMyAdmin

phpMyAdmin是一個(gè)非常受歡迎的基于web的MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)管理工具。它能夠創(chuàng)建和刪除數(shù)據(jù)庫(kù)，創(chuàng)建/刪除/修改表格,刪除/編輯/新增字段，執(zhí)行SQL腳本等。

缺點(diǎn)：

SQL語(yǔ)法不高亮

2、數(shù)據(jù)庫(kù)管理工具NavicatLite

Navicat是一套快速、可靠并價(jià)格相宜的資料庫(kù)管理工具，大可使用來(lái)簡(jiǎn)化資料庫(kù)的管理及降低系統(tǒng)管理成本。它的設(shè)計(jì)符合資料庫(kù)管理員、開(kāi)發(fā)人員及中小企業(yè)的需求。Navicat是以直覺(jué)化的使用者圖形介面所而建的，讓你可以以安全且簡(jiǎn)單的方式建立、組織、存取并共用資訊。Navicat支持的數(shù)據(jù)庫(kù)包括MySQL、Oracle、SQLite、PostgreSQL和SQLServer等。

Navicat提供商業(yè)版NavicatPremium和免費(fèi)的版本NavicatLite。但目前Navicat已不再提供LITE版本。

缺點(diǎn)：

免費(fèi)版本已停止更新。

3、數(shù)據(jù)庫(kù)管理工具DBeaver

DBeaver是一個(gè)通用的數(shù)據(jù)庫(kù)管理工具和SQL客戶(hù)端，支持MySQL,PostgreSQL,Oracle,DB2,MSSQL,Sybase,Mimer,HSQLDB,Derby,以及其他兼容JDBC的數(shù)據(jù)庫(kù)。DBeaver提供一個(gè)圖形界面用來(lái)查看數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)構(gòu)、執(zhí)行SQL查詢(xún)和腳本，瀏覽和導(dǎo)出數(shù)據(jù)，處理BLOB/CLOB數(shù)據(jù)，修改數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)構(gòu)等等。

4、MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)建模工具M(jìn)ySQLWorkbench

MySQLWorkbench是數(shù)據(jù)庫(kù)架構(gòu)師和開(kāi)發(fā)人員的可視化數(shù)據(jù)庫(kù)設(shè)計(jì)、管理的工具，它是著名的數(shù)據(jù)庫(kù)設(shè)計(jì)工具DBDesigner4的繼任者。你可以用MySQLWorkbench設(shè)計(jì)和創(chuàng)建新的數(shù)據(jù)庫(kù)圖示，建立數(shù)據(jù)庫(kù)文檔。它同時(shí)有開(kāi)源和商業(yè)化的兩個(gè)版本。可以在Windows，Linux和MACOSX上使用。

它在2016年十月份成為一個(gè)穩(wěn)定的工具。

缺點(diǎn)：

比phpMyAdmin更復(fù)雜。

1.oracle sql developer:甲骨文官方出品,優(yōu)點(diǎn)在于:精準(zhǔn)書(shū)簽,可方便設(shè)置...

2.pl sql developer:集成開(kāi)發(fā)環(huán)境,專(zhuān)用于oracle數(shù)據(jù)庫(kù)存儲(chǔ)的程序單元...

3.toad:收費(fèi)工具。精確書(shū)簽、自動(dòng)大小寫(xiě)關(guān)鍵字、可設(shè)智能提示范圍、語(yǔ)法糾錯(cuò)等。

4.EnterpriseManager,企業(yè)管理器,圖形化數(shù)據(jù)管理。

5.si object browser:在圖形用戶(hù)界面上對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)象創(chuàng)建編輯,可高效輔助開(kāi)發(fā)...